Mochignano si trova nella valle del Bagnone, compreso tra il corso d'acqua principale a sinistra e il torrente Mangiola a destra. Č suddiviso nelle due localitā principali di Mochignano Sopra e Mochignano Sotto o Mochignano Chiesa, e quelle minori di Cā Zani e Cā Maffei. Il nucleo originario si trovava a Mochignano Sopra, nato nell'antichitā dalla scomparsa di un altro paesino, Paneschio, sepolto da una frana. La vicina localitā di Agnano, divenne Monco di Agnano, Moncognano, Mocognano e infine Mochignano. La parta alta del paese č aggrappata alla collina, composta da case in pietra ben tenute e stretti vicoli lastricati, con il cimitero posto appena fuori il borgo.
Pių sotto si trova Mochignano Chiesa, abitato pių piccolo, caratterizzato dall'aguzzo campanile della chiesa di Santa Maria Assunta. La chiesa č il risultato di successive ristrutturazioni, operate su una vecchia costruzione sorta prima del XIII secolo, dedicata a San Bernardo e i cui primi atti risalgono al 1516. All’interno troviamo decorazioni di ispirazione paleocristiana del pittore triestino Domenico Bartoli e un pregevole tabernacolo in legno oro zecchino fine secolo XIX, sovrastato da una grande croce in legno di moda classica.