Nel Varignano Vecchio si trovano i resti di una villa romana del I secolo a.C., situata alle pendici del colle Muzzerone e alla fine di una piccola valle di olivi.
La villa si costituiva di numerosi ambienti con pavimenti in prevalenza di signino e a mosaico. Qui risiedevano il padrone e il fattore con le famiglie. Si trovano anche le terme, con i locali del praefurnium, tepidarium e frigidarium. Poco più in alto si trova la "pars rustica", la zona di lavoro, con le attrezzature per la spremitura delle olive, il torcularium, e per la conservazione dei cereali.
La villa fu abitata fino al IV secolo d.C., come dimostra il ritrovamento di vasellame e monete coeve, e fino al VI secolo con minore intensità. Una volta abbandonata, venne parzialmente curata dai monaci del vicino monastero delle Grazie.
I reperti più significativi degli scavi, un dolio granario, lucerne fittili, ami ed aghi bronzei da rete e monete di epoca republicana, sono esposti nell'Antiquarium.